这一篇与[day25]的主要差异在於资料集以及应用上的不同,
参考的官方攻略:
https://docs.abzu.ai/docs/tutorials/python/cancer_hcc.html
生物科学家常常搜寻一些生物标志,
像是参考攻略希望从肝癌患者与正常人之间,
藉由血液中游离的DNA片段甲基化的位置及数量,
来帮助判断未知的病人是否得到肝癌。
不过你可能会问不是靠侵入式切开来看就知道结果了吗?
使用侵入式的方式有可能会提高扩散的可能性,
相对来说,使用抽血的方式安全性比较高,但选择的生物标志也要够准才行,
或是绑定更多的生物标志一起做测试。
获取资料集:
安装及载入套件:
资料集已经以 高变异数特徵 才保留的方式清洗过一次,
我们可以看到游离DNA片段位於染色体上的位置以及甲基化的程度数值,
而target 0 代表正常人,1代表患者:
区分训练集 及 测试集,标签为target:
开始训练:
现在能以图示的方式查看那些游离基因位点与肝癌具有相关性:
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