我们的基因体时代-AI, Data和生物资讯 Day30-以终为始

上一篇我们的基因体时代-AI, Data和生物资讯 Day29-大数据追踪COVID病毒之演进想进一步分享怎麽使用序列来分析病毒序列的演进,会在持续补齐,30天实在是很短,而未来基因体学的数据和应用将会紧密的跟AI结合,相关的配套也会越来越纯熟,迎来的会是非常蓬勃发展的生物科技发展。

30天的过程,比想像中过得还快,每天晚上吃完饭,总是会空一段时间,打开电脑,思考怎麽延续昨日的主题,但又别流於太完美主义,不然永远写不完,因为很多主题其实是相当复杂的,只能先求有再求好,而写作就是一种强迫输出,如同一开头写的,Writing to Learn,这时代进步的速度不断刺激人们也得快速学习与迭代。

重新检视在一开始拟定的时间轴和相关资料:我们的基因体时代-AI, Data和生物资讯 Overview
原本计画会分成五周,有五大区块的内容分享,分别是:(1). 介绍机器学习在基因体学相关的进展,包含到比较前端的合成生物学 (2). 分子生物学和基因体学中的资料格式 (3). 介绍Bioconductor的相关工具 (4). 更进阶在生命科学中的人工智慧 (5).COVID时期的大数据。

整个过程中会发现,前面的1所包持的节奏比较刚好,2和3的部分之内容,可能真的比较多,很难两周完成,可能本身是可以独立为1个月份量的内容,4的部分基本上没有办法分享到,5则是勉强分享两天。

原本想要带到许多生命科学会用到的工具比如Benchling, Snapgene, Snythetic biology design tools, NIH API, Biopython, GATK, Cloud tools等,可惜真的是时间过少。我自己则是很喜欢分享序列分析的那块,且会把自己收集的资源列表找机会持续学习!

希望这短短的30天之分享,能激起更多人对这领域的兴趣,我们需要更多不同领域的人进入这领域,一起合作开创更多有益於这社会的事物!


这个月的规划贴在这篇文章中我们的基因体时代-AI, Data和生物资讯 Overview,也会持续调整!我们的基因体时代是我经营的部落格,如有对於生物资讯、检验医学、资料视觉化、R语言有兴趣的话,可以来交流交流!


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