上一篇我们的基因体时代-AI, Data和生物资讯 Day27-进阶人工智慧在分子生物学之应用又是明显的偷懒,之後会再好好补一下,感觉可能要比30天还长很多,才能让这些主题更将的论述完毕!为了能对应到当初提到的COVID相关的主题,这边再度往前跳跃,这次COVID疫情,已经快要两年了,其实全世界生医领域也因此有很多惊人的突破,其相关衍生的资料也非常多,毕竟各国需要合作,很多数据需要共享,这边先介绍一些开源跟COVID相关的资讯来源!
Disease.sh是一个开放API,提供根COVID相关的统计资料,其汇集来自14个地方。
covidAPI也提供另一个JSON相容前端的接口
美国约翰霍普金斯COVID19资料中心
这算是目前最重要的一个资料来源,里面有各国的每日统计资料包含新确诊人数、28天确诊总人数、死亡人数,目前还新增有疫苗接种人数的资讯,同时里面还有搭配世界地图的视觉化图表。
Nextstrain是一个获得脸书基金会补助的开源基因资料专案,其是目前最重要的病毒株基因序列变化的分析资料平台。
Nextstrain很特别的地方是除了本身汇集许多菌种定序资料外,本身也提供开源之分析系统,
这个月的规划贴在这篇文章中我们的基因体时代-AI, Data和生物资讯 Overview,也会持续调整!我们的基因体时代是我经营的部落格,如有对於生物资讯、检验医学、资料视觉化、R语言有兴趣的话,可以来交流交流!
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